Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFX1Q12986 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFX1Q12986 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFX1Q12986 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
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