Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN13Q12923 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN13Q12923 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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