Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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TP53BP1Q12888 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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TP53BP1Q12888 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
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TP53BP1Q12888 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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TP53BP1Q12888 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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TP53BP1Q12888 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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TP53BP1Q12888 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TP53BP1Q12888 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
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TP53BP1Q12888 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
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TP53BP1Q12888 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TP53BP1Q12888 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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