Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN1Q12860 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms