Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 IPI1YHR085W 1005 nt5.9□□□□□ -1.46
RTP1Q12751 GPI18YBR004C 1302 nt5.9□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YEH1YLL012W 1722 nt5.9□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YIR007WYIR007W 2295 nt5.9□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 MET3YJR010W 1536 nt5.89□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 RGT1YKL038W 3513 nt5.89□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ERC1YHR032W 1746 nt5.89□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.89□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 SPC42YKL042W 1092 nt5.89□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 GAT3YLR013W 426 nt5.89□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 CWC25YNL245C 540 nt5.89□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 MRL1YPR079W 1146 nt5.89□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 WHI4YDL224C 1950 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 CBP1YJL209W 1965 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YCR006CYCR006C 474 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 PAD1YDR538W 729 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ECM1YAL059W 639 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ECM15YBL001C 315 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 HSP78YDR258C 2436 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 PIF1YML061C 2580 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YBR138CYBR138C 1575 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 GIP2YER054C 1647 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 SSK22YCR073C 3996 nt5.88□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 VCX1YDL128W 1236 nt5.87□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ARP10YDR106W 855 nt5.87□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 SNZ3YFL059W 897 nt5.87□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 FMP48YGR052W 1110 nt5.87□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 SNZ2YNL333W 897 nt5.87□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YDR132CYDR132C 1488 nt5.87□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 TOS4YLR183C 1470 nt5.87□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 QDR3YBR043C 2070 nt5.86□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ARN2YHL047C 1863 nt5.86□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 JAC1YGL018C 555 nt5.86□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 MRPL24YMR193W 777 nt5.86□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 PFA3YNL326C 1011 nt5.86□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YBR016WYBR016W 387 nt5.86□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 VPS1YKR001C 2115 nt5.86□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 RFA1YAR007C 1866 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 THI21YPL258C 1656 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 KCH1YJR054W 1494 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 PCL6YER059W 1263 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ARO2YGL148W 1131 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 TDH3YGR192C 999 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 CBF1YJR060W 1056 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 NRM1YNR009W 750 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ENT2YLR206W 1842 nt5.85□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 PCL8YPL219W 1479 nt5.84□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 VTC2YFL004W 2487 nt5.84□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 SCW4YGR279C 1161 nt5.84□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ATG33YLR356W 594 nt5.84□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 ACC1YNR016C 6702 nt5.84□□□□□ -1.47
RTP1Q12751 YPL245WYPL245W 1365 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YHR045WYHR045W 1683 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 SNM1YDR478W 597 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 MRPL25YGR076C 474 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YJL068CYJL068C 900 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 RPB4YJL140W 666 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 PAU17YLL025W 375 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YPL113CYPL113C 1191 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 PKC1YBL105C 3456 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 ICE2YIL090W 1476 nt5.83□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 SMP1YBR182C 1359 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 SMF2YHR050W 1650 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 IDP1YDL066W 1287 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YIL028WYIL028W 399 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YMR147WYMR147W 672 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 RER2YBR002C 861 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 SER1YOR184W 1188 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 SMA1YPL027W 738 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 GEP3YOR205C 1671 nt5.82□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YAP1YML007W 1953 nt5.81□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YDR541CYDR541C 1035 nt5.81□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 CAB4YGR277C 918 nt5.81□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 PRP45YAL032C 1140 nt5.81□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YKR104WYKR104W 921 nt5.81□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 CSR1YLR380W 1227 nt5.81□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 STL1YDR536W 1710 nt5.81□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 GSH2YOL049W 1476 nt5.81□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 CLP1YOR250C 1338 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 SIP2YGL208W 1248 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 GTO1YGR154C 1071 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 NOP13YNL175C 1212 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YOL079WYOL079W 399 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YPL014WYPL014W 1146 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 PRE2YPR103W 864 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 UBC4YBR082C 447 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YPR195CYPR195C 330 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 ROG3YFR022W 2202 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 UGA1YGR019W 1416 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 TEF1YPR080W 1377 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 TEF2YBR118W 1377 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 MCM4YPR019W 2802 nt5.8□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YEL077CYEL077C 3834 nt5.79□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YIL067CYIL067C 2037 nt5.79□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 TAX4YJL083W 1815 nt5.79□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YDR134CYDR134C 411 nt5.79□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 YGR011WYGR011W 327 nt5.79□□□□□ -1.48
RTP1Q12751 RCL1YOL010W 1104 nt5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms