Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 RRG9YNL213C 645 nt8.91□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 NTG2YOL043C 1143 nt8.91□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 PNT1YOR266W 1272 nt8.91□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 YSY6YBR162W-A 198 nt8.91□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 LDB16YCL005W 771 nt8.91□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 TLG1YDR468C 675 nt8.9□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 ARC15YIL062C 465 nt8.9□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 ERG27YLR100W 1044 nt8.9□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt8.9□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 ARG1YOL058W 1263 nt8.9□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 MDH2YOL126C 1134 nt8.9□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 HUA2YOR284W 732 nt8.9□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 HUT1YPL244C 1020 nt8.9□□□□□ -0.98
MSB4Q12317 ATG32YIL146C 1590 nt8.9□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 DUN1YDL101C 1542 nt8.9□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 ARH1YDR376W 1482 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 IDS2YJL146W 1410 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 MRN1YPL184C 1839 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 UIP5YKR044W 1332 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 SCM3YDL139C 672 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 TWF1YGR080W 999 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 Q0143Q0143 153 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YJL114WYJL114W 681 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 NOP13YNL175C 1212 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 SPR2YOR214C 711 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 MET16YPR167C 786 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 TOS4YLR183C 1470 nt8.89□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 PMT7YDR307W 1989 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 snR83snR83 306 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 RUB1YDR139C 234 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 CPR1YDR155C 489 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 CHO1YER026C 831 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 DOG2YHR043C 741 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 DOG1YHR044C 741 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YJL068CYJL068C 900 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 VMA5YKL080W 1179 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 DAL80YKR034W 810 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 RPB8YOR224C 441 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YPC1YBR183W 951 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 MET13YGL125W 1803 nt8.88□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 CDC40YDR364C 1368 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 TAF10YDR167W 621 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 BMH1YER177W 804 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 FOL2YGR267C 732 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YIM1YMR152W 1098 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 DDR48YMR173W 1293 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YBL070CYBL070C 321 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YPL205CYPL205C 345 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 ILV6YCL009C 930 nt8.87□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 RBS1YDL189W 1374 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 BDS1YOL164W 1941 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YDR132CYDR132C 1488 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YCR022CYCR022C 345 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 IWR1YDL115C 1062 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 SMB1YER029C 591 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 SCM4YGR049W 564 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 MRP4YHL004W 1185 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 ELP6YMR312W 822 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 FIT2YOR382W 462 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 OXR1YPL196W 822 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 CMD1YBR109C 444 nt8.86□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 MPE1YKL059C 1326 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 GLE2YER107C 1098 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 CBF1YJR060W 1056 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YJU3YKL094W 942 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YNL337WYNL337W 255 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YBL112CYBL112C 318 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YBR144CYBR144C 315 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YKR023WYKR023W 1593 nt8.85□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 TRM11YOL124C 1302 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 FMP40YPL222W 2067 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 ATP16YDL004W 483 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 DET1YDR051C 1005 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 KEG1YFR042W 603 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 RPP1YHR062C 882 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 PER33YLR064W 822 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 PRM9YAR031W 897 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 YPR172WYPR172W 603 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 ICS2YBR157C 768 nt8.84□□□□□ -0.99
MSB4Q12317 LCL3YGL085W 825 nt8.83□□□□□ -1
MSB4Q12317 ARD1YHR013C 717 nt8.83□□□□□ -1
MSB4Q12317 PEX18YHR160C 852 nt8.83□□□□□ -1
MSB4Q12317 EBP2YKL172W 1284 nt8.83□□□□□ -1
MSB4Q12317 PFA3YNL326C 1011 nt8.83□□□□□ -1
MSB4Q12317 YPL102CYPL102C 303 nt8.83□□□□□ -1
MSB4Q12317 VCX1YDL128W 1236 nt8.82□□□□□ -1
MSB4Q12317 ASP1YDR321W 1146 nt8.82□□□□□ -1
MSB4Q12317 FMO1YHR176W 1299 nt8.82□□□□□ -1
MSB4Q12317 YKL083WYKL083W 615 nt8.82□□□□□ -1
MSB4Q12317 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt8.82□□□□□ -1
MSB4Q12317 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt8.82□□□□□ -1
MSB4Q12317 ENV7YPL236C 1095 nt8.82□□□□□ -1
MSB4Q12317 TAH18YPR048W 1872 nt8.82□□□□□ -1
MSB4Q12317 VPS30YPL120W 1674 nt8.81□□□□□ -1
MSB4Q12317 DHH1YDL160C 1521 nt8.81□□□□□ -1
MSB4Q12317 PEX28YHR150W 1740 nt8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms