Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GALNT1Q10472 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT1Q10472 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms