Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYCNQ0VAF6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYCNQ0VAF6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms