Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A11Q08AI6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC38A11Q08AI6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms