Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 CHL4YDR254W 1377 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 RPT2YDL007W 1314 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 ECM7YLR443W 1347 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 HEM3YDL205C 984 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 ENT5YDR153C 1236 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 TAF10YDR167W 621 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 EAF5YEL018W 840 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 NSG1YHR133C 876 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 PGA2YNL149C 390 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 RDL1YOR285W 420 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 HXT17YNR072W 1695 nt6.06□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 EMW1YNL313C 2715 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 YAP1802YGR241C 1707 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 HPF1YOL155C 2904 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 LYS5YGL154C 819 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 SPL2YHR136C 447 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 YNL194CYNL194C 906 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 PEP4YPL154C 1218 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 HAL1YPR005C 885 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 SLX5YDL013W 1860 nt6.05□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 DIT2YDR402C 1470 nt6.04□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 YDL027CYDL027C 1263 nt6.03□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 ADK2YER170W 678 nt6.03□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 KIP2YPL155C 2121 nt6.03□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 RCK1YGL158W 1539 nt6.03□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 YEH2YLR020C 1617 nt6.03□□□□□ -1.44
CTI6Q08923 NIT2YJL126W 924 nt6.02□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 HOR7YMR251W-A 180 nt6.02□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 LEM3YNL323W 1245 nt6.02□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 DAK1YML070W 1755 nt6.02□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 THP1YOL072W 1368 nt6.02□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 HXT4YHR092C 1731 nt6.02□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 ASF2YDL197C 1578 nt6.01□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 DOA1YKL213C 2148 nt6.01□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 MRPL15YLR312W-A 762 nt6.01□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 ODC2YOR222W 924 nt6.01□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 MNN2YBR015C 1794 nt6.01□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 NTH2YBR001C 2343 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 SIA1YOR137C 1869 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 ADE4YMR300C 1533 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 YIR007WYIR007W 2295 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 GLO2YDR272W 825 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 CAB1YDR531W 1104 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 YGL072CYGL072C 360 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 VHS1YDR247W 1386 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 SIR2YDL042C 1689 nt6□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 DDC1YPL194W 1839 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 ACC1YNR016C 6702 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 VMS1YDR049W 1899 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 KTI12YKL110C 942 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 OCA1YNL099C 717 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 YNL228WYNL228W 777 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 RPA49YNL248C 1248 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 SCO1YBR037C 888 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 STE50YCL032W 1041 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 PTR2YKR093W 1806 nt5.99□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 CDC43YGL155W 1131 nt5.98□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 NQM1YGR043C 1002 nt5.98□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 PRS1YKL181W 1284 nt5.98□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 YML131WYML131W 1098 nt5.98□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 CUE5YOR042W 1236 nt5.98□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 ELC1YPL046C 300 nt5.98□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 BSC5YNR069C 1470 nt5.97□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 NMT1YLR195C 1368 nt5.97□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 NUP116YMR047C 3342 nt5.97□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 NRD1YNL251C 1728 nt5.96□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 SSZ1YHR064C 1617 nt5.96□□□□□ -1.45
CTI6Q08923 PEX7YDR142C 1128 nt5.96□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 BNA6YFR047C 888 nt5.96□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 YKR073CYKR073C 321 nt5.96□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 YNL134CYNL134C 1131 nt5.96□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 ASN1YPR145W 1719 nt5.96□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 GWT1YJL091C 1473 nt5.96□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 CLB4YLR210W 1383 nt5.95□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 ECM3YOR092W 1842 nt5.95□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 SOH1YGL127C 384 nt5.95□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 DOM34YNL001W 1161 nt5.95□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 YPL191CYPL191C 1083 nt5.95□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 VTH1YIL173W 4650 nt5.95□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 VTH2YJL222W 4650 nt5.95□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 FUN19YAL034C 1242 nt5.94□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 snR10snR10 245 nt5.94□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 YEF1YEL041W 1488 nt5.94□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 AVO1YOL078W 3531 nt5.94□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 MKS1YNL076W 1755 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 IMA2YOL157C 1770 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 ERG4YGL012W 1422 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 SMF3YLR034C 1422 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 BIT2YBR270C 1638 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 ERD1YDR414C 1089 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 NOP16YER002W 696 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 YJL193WYJL193W 1209 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 YAR023CYAR023C 540 nt5.93□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 IWR1YDL115C 1062 nt5.92□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 MTW1YAL034W-A 870 nt5.92□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 ACP1YKL192C 378 nt5.92□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 RFA2YNL312W 822 nt5.92□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 YPL199CYPL199C 723 nt5.92□□□□□ -1.46
CTI6Q08923 PDI1YCL043C 1569 nt5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.1 ms