Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD47Q08722 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD47Q08722 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD47Q08722 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD47Q08722 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD47Q08722 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD47Q08722 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD47Q08722 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD47Q08722 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD47Q08722 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD47Q08722 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD47Q08722 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD47Q08722 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD47Q08722 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD47Q08722 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD47Q08722 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD47Q08722 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD47Q08722 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD47Q08722 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD47Q08722 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD47Q08722 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD47Q08722 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD47Q08722 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD47Q08722 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD47Q08722 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD47Q08722 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD47Q08722 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD47Q08722 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD47Q08722 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD47Q08722 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD47Q08722 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD47Q08722 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD47Q08722 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD47Q08722 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD47Q08722 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD47Q08722 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD47Q08722 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD47Q08722 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD47Q08722 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD47Q08722 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD47Q08722 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms