Protein–RNA interactions for Protein: Q06702

CDA1, Chitin deacetylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDA1Q06702 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 MRT4YKL009W 711 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 YKL031WYKL031W 414 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 RUF5-1RUF5-1 710 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 RUF5-2RUF5-2 710 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 RRP15YPR143W 753 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 HIR1YBL008W 2523 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 MDM31YHR194W 1740 nt5.91□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 PRP19YLL036C 1512 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 GUF1YLR289W 1938 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 YDR282CYDR282C 1245 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 RPN11YFR004W 921 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 HPM1YIL110W 1134 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 RSM26YJR101W 801 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 RPS31YLR167W 459 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 ATG16YMR159C 453 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 ARL3YPL051W 597 nt5.9□□□□□ -1.46
CDA1Q06702 SSK22YCR073C 3996 nt5.9□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 DSF1YEL070W 1509 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 DRN1YGR093W 1524 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YNR073CYNR073C 1509 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 snR63snR63 255 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 PTC1YDL006W 846 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YET3YDL072C 612 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 GIC2YDR309C 1152 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 MOG1YJR074W 657 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YOR289WYOR289W 756 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YPL102CYPL102C 303 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YPR114WYPR114W 948 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 GPB2YAL056W 2643 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 KCH1YJR054W 1494 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 PXL1YKR090W 2121 nt5.89□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YDL114WYDL114W 927 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YEL068CYEL068C 333 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 LDS1YAL018C 978 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 GMH1YKR030W 822 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 PGA2YNL149C 390 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YNL217WYNL217W 981 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YPL191CYPL191C 1083 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 MAD3YJL013C 1548 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 CLN2YPL256C 1638 nt5.88□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 MAK31YCR020C-A 267 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 LUC7YDL087C 786 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 RHO3YIL118W 696 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 POL32YJR043C 1053 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 EBP2YKL172W 1284 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 ECM1YAL059W 639 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 RPL10YLR075W 666 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YIM2YMR151W 438 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YIF1YNL263C 945 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 CBP6YBR120C 489 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 CUS1YMR240C 1311 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 ORC5YNL261W 1440 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 MUP3YHL036W 1641 nt5.87□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 XBP1YIL101C 1944 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 ERG1YGR175C 1491 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 ATG4YNL223W 1485 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SHE9YDR393W 1371 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YDL172CYDL172C 480 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 PHB1YGR132C 864 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YJU3YKL094W 942 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 LTO1YNL260C 597 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YNR040WYNR040W 771 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 CKB2YOR039W 777 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 MRPS16YPL013C 366 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SMA1YPL027W 738 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YLL067CYLL067C 3618 nt5.86□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 RAD7YJR052W 1698 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 RAD3YER171W 2337 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SLD2YKL108W 1362 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 LYS21YDL131W 1323 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 AIM6YDL237W 1173 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YDR029WYDR029W 315 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 UBC6YER100W 753 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YFL012WYFL012W 447 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YIL089WYIL089W 618 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 HSP150YJL159W 1242 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 DAN1YJR150C 897 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 SLZ1YNL196C 897 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 YOR097CYOR097C 528 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 IDI1YPL117C 867 nt5.85□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 COQ6YGR255C 1440 nt5.84□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 MAL13YGR288W 1422 nt5.84□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 HSE1YHL002W 1359 nt5.84□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 HST4YDR191W 1113 nt5.84□□□□□ -1.47
CDA1Q06702 DID4YKL002W 699 nt5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39 ms