Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUCB1Q02818 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NUCB1Q02818 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms