Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGCS1Q01581 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGCS1Q01581 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms