Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A2Q01362 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A2Q01362 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms