Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MAT1AQ00266 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MAT1AQ00266 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms