Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA4Q00056 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA4Q00056 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms