Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKD1P98161 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKD1P98161 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKD1P98161 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PKD1P98161 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKD1P98161 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKD1P98161 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKD1P98161 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms