Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTRA4P83105 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA4P83105 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms