Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF3P61204 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF3P61204 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF3P61204 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF3P61204 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF3P61204 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF3P61204 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF3P61204 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF3P61204 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF3P61204 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARF3P61204 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF3P61204 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF3P61204 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF3P61204 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF3P61204 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARF3P61204 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARF3P61204 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARF3P61204 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARF3P61204 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARF3P61204 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARF3P61204 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARF3P61204 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARF3P61204 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARF3P61204 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARF3P61204 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms