Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVFC1-1P60608 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms