Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP1S2P56377 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms