Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCL23P55773 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCL23P55773 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCL23P55773 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCL23P55773 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL23P55773 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL23P55773 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCL23P55773 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCL23P55773 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL23P55773 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL23P55773 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL23P55773 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL23P55773 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL23P55773 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCL23P55773 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL23P55773 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL23P55773 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL23P55773 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL23P55773 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL23P55773 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCL23P55773 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCL23P55773 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCL23P55773 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCL23P55773 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCL23P55773 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCL23P55773 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL23P55773 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL23P55773 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL23P55773 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL23P55773 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL23P55773 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL23P55773 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCL23P55773 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL23P55773 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL23P55773 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL23P55773 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL23P55773 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL23P55773 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL23P55773 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCL23P55773 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL23P55773 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCL23P55773 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCL23P55773 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCL23P55773 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL23P55773 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL23P55773 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL23P55773 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL23P55773 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL23P55773 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCL23P55773 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL23P55773 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL23P55773 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL23P55773 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL23P55773 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL23P55773 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL23P55773 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL23P55773 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCL23P55773 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCL23P55773 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL23P55773 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL23P55773 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL23P55773 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL23P55773 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL23P55773 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms