Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFAP3P55082 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFAP3P55082 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFAP3P55082 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms