Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC12A3P55017 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A3P55017 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A3P55017 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms