Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EMP1P54849 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EMP1P54849 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EMP1P54849 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EMP1P54849 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EMP1P54849 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMP1P54849 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMP1P54849 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP1P54849 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP1P54849 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP1P54849 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP1P54849 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP1P54849 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMP1P54849 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMP1P54849 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMP1P54849 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMP1P54849 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMP1P54849 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMP1P54849 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms