Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN1P54253 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN1P54253 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN1P54253 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms