Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	CTR3	YLR411W	726 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	ALG5	YPL227C	1005 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	CLF1	YLR117C	2064 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	NUP116	YMR047C	3342 nt		5.25	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	RAD16	YBR114W	2373 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	MNS1	YJR131W	1650 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	PAL1	YDR348C	1500 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	GCS1	YDL226C	1059 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	AAD4	YDL243C	990 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	SUR2	YDR297W	1050 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	HMT1	YBR034C	1047 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	ENV7	YPL236C	1095 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	YPR195C	YPR195C	330 nt		5.24	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	MEC3	YLR288C	1425 nt		5.23	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	ORC5	YNL261W	1440 nt		5.23	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	HRP1	YOL123W	1605 nt		5.23	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	PGA3	YML125C	939 nt		5.23	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	RFA2	YNL312W	822 nt		5.23	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	COA2	YPL189C-A	207 nt		5.23	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	SED4	YCR067C	3198 nt		5.22	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	KRE9	YJL174W	831 nt		5.22	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	SOL1	YNR034W	966 nt		5.22	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	DIT1	YDR403W	1611 nt		5.22	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	MSE1	YOL033W	1611 nt		5.22	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	MGS1	YNL218W	1764 nt		5.21	□□□□□ -1.57
DSL1	P53847	ABF1	YKL112W	2196 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	FYV1	YDR024W	486 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	PAN6	YIL145C	930 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	MND2	YIR025W	1107 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	ZRT2	YLR130C	1269 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YAR061W	YAR061W	204 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	UBC4	YBR082C	447 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	MCM4	YPR019W	2802 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YBR138C	YBR138C	1575 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	TSL1	YML100W	3297 nt		5.21	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	SHM1	YBR263W	1473 nt		5.2	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	RTT103	YDR289C	1230 nt		5.2	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YOL079W	YOL079W	399 nt		5.2	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	DED81	YHR019C	1665 nt		5.2	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	PDR10	YOR328W	4695 nt		5.19	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YCR047W-A	YCR047W-A	207 nt		5.19	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	DFM1	YDR411C	1026 nt		5.19	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	PHA2	YNL316C	1005 nt		5.19	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	CDC21	YOR074C	915 nt		5.19	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	PRE2	YPR103W	864 nt		5.19	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	GPI18	YBR004C	1302 nt		5.19	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	RAT1	YOR048C	3021 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	GEP3	YOR205C	1671 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	VHC1	YBR235W	3363 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	HFA1	YMR207C	6372 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	SHE10	YGL228W	1734 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YIR043C	YIR043C	693 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	FMP33	YJL161W	543 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	SEN34	YAR008W	828 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	LEM3	YNL323W	1245 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	GPM3	YOL056W	912 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	SCP1	YOR367W	603 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	STE50	YCL032W	1041 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	NUP1	YOR098C	3231 nt		5.18	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	DAK1	YML070W	1755 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	PRS2	YER099C	957 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YJR115W	YJR115W	510 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	RRT7	YLL030C	342 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	RPS19B	YNL302C	435 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	PIN2	YOR104W	849 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	QDR1	YIL120W	1692 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	PUF3	YLL013C	2640 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	CAF4	YKR036C	1932 nt		5.17	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	LEU1	YGL009C	2340 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YCR006C	YCR006C	474 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	UPS3	YDR185C	540 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	NPY1	YGL067W	1155 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YLR184W	YLR184W	348 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	ECM19	YLR390W	339 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	TGS1	YPL157W	948 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	TIP41	YPR040W	1071 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	MCH4	YOL119C	1506 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	MOT2	YER068W	1764 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	MMP1	YLL061W	1752 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	FAA4	YMR246W	2085 nt		5.16	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	KIP2	YPL155C	2121 nt		5.15	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	HRK1	YOR267C	2280 nt		5.15	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	STE7	YDL159W	1548 nt		5.15	□□□□□ -1.58
DSL1	P53847	YDR154C	YDR154C	351 nt		5.15	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YGR122W	YGR122W	1209 nt		5.15	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	MTF1	YMR228W	1026 nt		5.15	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	ADE3	YGR204W	2841 nt		5.15	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	SAC1	YKL212W	1872 nt		5.15	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	LYS2	YBR115C	4179 nt		5.15	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	SPO7	YAL009W	780 nt		5.14	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	NPT1	YOR209C	1290 nt		5.14	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YPL071C	YPL071C	471 nt		5.14	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	ZUO1	YGR285C	1302 nt		5.14	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YGR266W	YGR266W	2106 nt		5.14	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	RPT1	YKL145W	1404 nt		5.14	□□□□□ -1.59
DSL1	P53847	YFL034W	YFL034W	3222 nt		5.13	□□□□□ -1.59

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