Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC5A3P53794 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC5A3P53794 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC5A3P53794 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms