Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MVDP53602 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MVDP53602 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MVDP53602 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MVDP53602 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MVDP53602 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MVDP53602 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MVDP53602 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MVDP53602 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MVDP53602 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MVDP53602 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MVDP53602 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MVDP53602 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MVDP53602 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MVDP53602 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MVDP53602 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MVDP53602 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MVDP53602 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MVDP53602 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MVDP53602 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MVDP53602 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MVDP53602 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MVDP53602 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MVDP53602 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MVDP53602 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MVDP53602 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MVDP53602 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MVDP53602 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MVDP53602 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MVDP53602 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MVDP53602 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MVDP53602 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MVDP53602 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MVDP53602 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MVDP53602 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MVDP53602 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MVDP53602 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MVDP53602 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MVDP53602 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MVDP53602 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MVDP53602 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MVDP53602 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MVDP53602 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MVDP53602 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MVDP53602 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MVDP53602 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MVDP53602 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MVDP53602 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MVDP53602 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MVDP53602 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MVDP53602 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MVDP53602 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MVDP53602 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MVDP53602 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MVDP53602 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms