Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACLYP53396 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACLYP53396 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACLYP53396 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ACLYP53396 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACLYP53396 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACLYP53396 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACLYP53396 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACLYP53396 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACLYP53396 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACLYP53396 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACLYP53396 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACLYP53396 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACLYP53396 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACLYP53396 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACLYP53396 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACLYP53396 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACLYP53396 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACLYP53396 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACLYP53396 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACLYP53396 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACLYP53396 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ACLYP53396 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACLYP53396 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACLYP53396 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACLYP53396 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACLYP53396 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACLYP53396 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACLYP53396 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACLYP53396 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ACLYP53396 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACLYP53396 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACLYP53396 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACLYP53396 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACLYP53396 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACLYP53396 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACLYP53396 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACLYP53396 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACLYP53396 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ACLYP53396 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACLYP53396 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACLYP53396 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACLYP53396 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACLYP53396 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACLYP53396 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACLYP53396 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACLYP53396 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACLYP53396 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACLYP53396 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ACLYP53396 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACLYP53396 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACLYP53396 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACLYP53396 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACLYP53396 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACLYP53396 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACLYP53396 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACLYP53396 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACLYP53396 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ACLYP53396 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACLYP53396 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACLYP53396 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms