Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUBP1P53384 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUBP1P53384 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP1P53384 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms