Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA2P51587 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA2P51587 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms