Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DAP3P51398 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DAP3P51398 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DAP3P51398 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DAP3P51398 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DAP3P51398 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DAP3P51398 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DAP3P51398 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DAP3P51398 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DAP3P51398 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DAP3P51398 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DAP3P51398 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DAP3P51398 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DAP3P51398 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DAP3P51398 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DAP3P51398 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DAP3P51398 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DAP3P51398 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DAP3P51398 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DAP3P51398 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DAP3P51398 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms