Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB28P51157 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB28P51157 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB28P51157 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB28P51157 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB28P51157 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB28P51157 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB28P51157 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB28P51157 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB28P51157 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB28P51157 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB28P51157 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB28P51157 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB28P51157 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB28P51157 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB28P51157 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB28P51157 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB28P51157 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB28P51157 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB28P51157 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB28P51157 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB28P51157 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB28P51157 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB28P51157 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB28P51157 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB28P51157 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB28P51157 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB28P51157 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB28P51157 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms