Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFBP49765 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFBP49765 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFBP49765 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms