Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCKSL1P49006 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCKSL1P49006 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCKSL1P49006 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms