Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A3P47895 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms