Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL21P46778 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL21P46778 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL21P46778 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL21P46778 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL21P46778 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL21P46778 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL21P46778 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL21P46778 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL21P46778 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL21P46778 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL21P46778 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL21P46778 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL21P46778 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL21P46778 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL21P46778 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL21P46778 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPL21P46778 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL21P46778 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL21P46778 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL21P46778 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL21P46778 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL21P46778 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL21P46778 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL21P46778 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL21P46778 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL21P46778 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL21P46778 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL21P46778 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL21P46778 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms