Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL27AP46776 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL27AP46776 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms