Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATRXP46100 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRXP46100 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRXP46100 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRXP46100 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRXP46100 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRXP46100 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRXP46100 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRXP46100 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRXP46100 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRXP46100 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRXP46100 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRXP46100 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRXP46100 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRXP46100 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRXP46100 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRXP46100 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRXP46100 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRXP46100 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRXP46100 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRXP46100 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRXP46100 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRXP46100 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRXP46100 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRXP46100 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRXP46100 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRXP46100 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRXP46100 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRXP46100 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRXP46100 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRXP46100 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRXP46100 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms