Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP5P45974 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP5P45974 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP5P45974 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP5P45974 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP5P45974 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP5P45974 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP5P45974 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP5P45974 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP5P45974 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP5P45974 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP5P45974 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP5P45974 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP5P45974 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP5P45974 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP5P45974 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP5P45974 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP5P45974 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP5P45974 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP5P45974 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP5P45974 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP5P45974 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP5P45974 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP5P45974 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP5P45974 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP5P45974 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP5P45974 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP5P45974 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP5P45974 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP5P45974 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP5P45974 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP5P45974 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP5P45974 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP5P45974 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP5P45974 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP5P45974 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP5P45974 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP5P45974 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP5P45974 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP5P45974 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP5P45974 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP5P45974 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP5P45974 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP5P45974 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP5P45974 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP5P45974 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP5P45974 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP5P45974 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP5P45974 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP5P45974 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP5P45974 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP5P45974 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP5P45974 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP5P45974 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP5P45974 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP5P45974 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP5P45974 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP5P45974 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP5P45974 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms