Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEA3P43357 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAGEA3P43357 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms