Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PI4KAP42356 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms