Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TMPOP42166 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMPOP42166 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMPOP42166 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMPOP42166 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMPOP42166 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMPOP42166 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMPOP42166 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMPOP42166 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMPOP42166 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TMPOP42166 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMPOP42166 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMPOP42166 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMPOP42166 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMPOP42166 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMPOP42166 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMPOP42166 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMPOP42166 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMPOP42166 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMPOP42166 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TMPOP42166 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMPOP42166 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMPOP42166 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMPOP42166 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMPOP42166 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMPOP42166 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMPOP42166 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMPOP42166 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMPOP42166 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMPOP42166 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TMPOP42166 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
TMPOP42166 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMPOP42166 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMPOP42166 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMPOP42166 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMPOP42166 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMPOP42166 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMPOP42166 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMPOP42166 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMPOP42166 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMPOP42166 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TMPOP42166 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
TMPOP42166 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMPOP42166 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMPOP42166 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMPOP42166 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMPOP42166 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMPOP42166 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TMPOP42166 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMPOP42166 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMPOP42166 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms