Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC1P41238 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APOBEC1P41238 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC1P41238 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms