Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDH1P40925 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDH1P40925 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDH1P40925 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDH1P40925 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDH1P40925 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDH1P40925 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDH1P40925 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDH1P40925 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH1P40925 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH1P40925 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH1P40925 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH1P40925 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH1P40925 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH1P40925 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH1P40925 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDH1P40925 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDH1P40925 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDH1P40925 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDH1P40925 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MDH1P40925 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDH1P40925 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDH1P40925 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDH1P40925 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDH1P40925 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDH1P40925 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDH1P40925 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MDH1P40925 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MDH1P40925 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDH1P40925 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDH1P40925 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDH1P40925 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDH1P40925 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDH1P40925 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDH1P40925 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDH1P40925 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms