Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC26A3P40879 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC26A3P40879 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms