Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	YDR417C	YDR417C	372 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	ECT1	YGR007W	972 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	TDH3	YGR192C	999 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	CBF1	YJR060W	1056 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	MRP17	YKL003C	396 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	UIP4	YPL186C	915 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	AXL2	YIL140W	2472 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	KCH1	YJR054W	1494 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	GCN20	YFR009W	2259 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	YDL119C	YDL119C	924 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	YHR127W	YHR127W	732 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	DCN1	YLR128W	810 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	SFT2	YBL102W	648 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	YCL012C	YCL012C	405 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	SNF3	YDL194W	2655 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	ARO10	YDR380W	1908 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	PRO2	YOR323C	1371 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	EMP46	YLR080W	1335 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	ADE13	YLR359W	1449 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	YEL067C	YEL067C	588 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	CAX4	YGR036C	720 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	YJL068C	YJL068C	900 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	FUN19	YAL034C	1242 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	MIM2	YLR099W-A	264 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	MRP21	YBL090W	534 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	ZPS1	YOL154W	750 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	RER2	YBR002C	861 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	PEX32	YBR168W	1242 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	TUP1	YCR084C	2142 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	AFT1	YGL071W	2073 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	KRE6	YPR159W	2163 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	CAF4	YKR036C	1932 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	PRP43	YGL120C	2304 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	NDC1	YML031W	1968 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	IPI1	YHR085W	1005 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	BUD22	YMR014W	1560 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	RPT6	YGL048C	1218 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	RPB4	YJL140W	666 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	TLG2	YOL018C	1194 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	YPL102C	YPL102C	303 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	MKC7	YDR144C	1791 nt		4.47	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	ASA1	YPR085C	1332 nt		4.46	□□□□□ -1.69
SHE2	P36068	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YAP1	YML007W	1953 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	THI5	YFL058W	1023 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	THI12	YNL332W	1023 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YIL067C	YIL067C	2037 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	CRT10	YOL063C	2874 nt		4.46	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	GAS3	YMR215W	1575 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	APJ1	YNL077W	1587 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	ASK10	YGR097W	3441 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	SEN34	YAR008W	828 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	SSP120	YLR250W	705 nt		4.45	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	ZRT1	YGL255W	1131 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YKL023W	YKL023W	834 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	POM33	YLL023C	840 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	HLJ1	YMR161W	675 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	IMD3	YLR432W	1572 nt		4.44	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	SEH1	YGL100W	1050 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	MAP2	YBL091C	1266 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	TRS33	YOR115C	807 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	SEC9	YGR009C	1956 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YMD8	YML038C	1329 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.43	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	NOB1	YOR056C	1380 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	LUC7	YDL087C	786 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	RMR1	YGL250W	726 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	DBF2	YGR092W	1719 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YLR346C	YLR346C	306 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YBR056C-B	YBR056C-B	159 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	SIF2	YBR103W	1608 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.42	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	YGR125W	YGR125W	3111 nt		4.41	□□□□□ -1.7
SHE2	P36068	FUM1	YPL262W	1467 nt		4.4	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YMR102C	YMR102C	2505 nt		4.4	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	PAP1	YKR002W	1707 nt		4.4	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	MPS3	YJL019W	2049 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	APL6	YGR261C	2430 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	RPS16B	YDL083C	432 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	SCM3	YDL139C	672 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	TEF4	YKL081W	1239 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YML131W	YML131W	1098 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	COG5	YNL051W	1212 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	ARG1	YOL058W	1263 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	VHS2	YIL135C	1311 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YJR124C	YJR124C	1347 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YPL245W	YPL245W	1365 nt		4.39	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	NSG1	YHR133C	876 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.38	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.38	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.4 ms