Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYLC1P35663 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYLC1P35663 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms